VirusTotalで利用可能なAPIには、無料で利用可能なPublic APIと、有償で利用可能なPremium API (Private API)の2種類があり、Public APIには一部制限があります。
特に大きな制限として、「クライアントへのセキュリティサービスのために利用することができない」ことが挙げられます。